전공동아리 또는 전공연구회는 과외활동의 심화학습과정에 해당되는 것으로 전임 및 겸임교수들의 전공 또는 강의 분야를 중심으로 1교수가 1개의 전공동아리를 지도한다. 철도운전시스템과에서는 현재 3개의 전공동아리를 운영하며, 원하는 학생들을 대상으로 자신의 관심분야에 따라 전공동아리에 가입하는 것을 권장한다.

전공동아리 운영목적은 본인이 희망하는 분야에 대하여 동아리 회원 스스로 학습 및 연구하여 전공분야에 대한 지식을 확대하는 것이다. 전공 동아리 활동을 통해 우수한 능력을 획득한 학생에게 필요 업체에 우선적으로 추천하여 활성화를 위한 동기부여를 한다.